桓峰基因——科技改变未来

ATAC-Seq

ATAC-Seq（Assay for Transposase-Accessible Chromatin using Sequencing）。该技术通过改造后活性极高的转座酶介导，对染色质结构开放区域进行捕获测序，仅需少量细胞便可获得实时全基因组活性调控序列信息，广泛应用于转录因子结合分析、核小体定位、活性调控元件分布等研究，在表观遗传机制研究领域有广阔的应用前景。

技术优势

1、所需的样本量少。可低至数百个细胞甚至更低的细胞量即可满足建库，更加适用于珍贵稀少的样本，且ATAC-seq无片段选择性，所以这种方法可以同时获得染色质开放区域、转录因子的结合位点、核小体的调控区域和染色质状态等信息。

2、样本准备周期短。相比于其他方法需要进行复杂的样本准备，ATAC-seq样本准备简单快捷，从而减少了长时间操作不当导致的样本的不稳定。

技术路线

研究内容

ATAC-seq的结果，通常会分两大类，一类是核小体定位，一类是转录因子。发展到现在，关注转录因子的群体越来越多，通过获得的peak进行motif分析，然后预测motif对应的转录因子来进行后续的研究。当然，基于开放染色质区域通常是基因的启动子调控区域，所以将染色质开放区与基于的表达情况进行关系分析，即ATAC-seq+RNA-seq进行关联分析，来找寻关键的转录因子调控的关键靶基因。

信息分析内容

1、染色质开放性图谱绘制；

2、找调控生物学过程的关键转录因子；

3、找哪个转录因子调控了研究的基因；

4、找转录因子调控的靶基因；

5、新型增强子的鉴定；

6、核小体定位；

7、探索与疾病有关的调控机制。