描述
DNA甲基化是重要的表观遗传学标记信息,获得全基因组范围内所有C位点的甲基化水平数据,对表观遗传学的时空特异性研究具有重要意义。Bisulfite甲基化测序是以新一代高通量测序平台为基础,结合全基因组Bisulfite处理和生物信息数据分析技术,进行低成本、高效率、高准确度的全基因组DNA甲基化水平图谱绘制。全基因组甲基化Bisulfite测序是DNA甲基化研究的黄金标准,它通过Bisulfite处理和全基因组DNA测序结合的方式,对整个基因组上的甲基化情况进行分析,具有单碱基的分辨率,可精确评估单个C碱基的甲基化水平,覆盖范围广。它可以构建精细甲基化图谱,建立表观遗传学研究数据库,为后续大规模开展不同样品间的甲基化差异分析提供参考图谱。
技术优势
基于全基因组重亚硫酸盐转化的WGBS法,实现单碱基分辨率的甲基化位点精准、高效定位。精准获得全基因组甲基化的C位点,是甲基化测序的金标准。全面分析不同处理对全基因组甲基化水平的影响,快速准确地找到差异甲基化区域。
技术稳定性、重复性好:从样本检测到文库构建、上机测序,每一步均有严格的标准操作Sop和对应的质控标准,保证每一个样本都得到真实的测序结果。
Bisulfite转化率高:经过不断优化建库方案,甲基化建库BS平均转化率高达99 %以上,作为文库构建的质控指标进行严格控制。
单碱基分辨率:精确分析每一个C碱基的甲基化状态。
准确性和可靠性高:准确区分甲基化的C和未甲基化的C。
检测范围广:覆盖全基因组范围内的所有位点。
无偏向性:反映真实的甲基化状态。
样品起始量低:华大基因经过不断的研发,样本起始量不断降低,起始量低至pg级。
多组关联分析:具有丰富多组学分析经验,专项开发,可根据项目需求进行多个组学关联分析。
技术路线
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研究内容
通过研究DNA甲基化与肿瘤、神经变性疾病和自身免疫性疾病等的相关性,以及胚胎发育、基因印迹和X染色体失活等过程,探讨表观遗传学研究的重要意义。
信息分析内容
描述
1) 数据基本处理与质控
2) 全基因组甲基化水平分析
3) 甲基化C碱基中CG, CHG 与CHH的分布比例
4) 甲基化CG、CHG和CHH的甲基化水平分布
5) 甲基化的CG,CHG,CHH附近碱基的序列特征分析
6) 染色体水平的甲基化C碱基密度分布
7) 基因组不同转录元件中的DNA平均甲基化水平
8) 全基因组差异甲基化区域DMR的检测
9) DMR相关基因的GO和Pathway分析
10)  其他定制化信息分析(可结合客户的需求,协商确定定制化信息分析内容。