1. 数据质控:测序质量值分布统计,测序碱基质量控制,测序数据产出统计;
2. 可比对测序数据的获得;
3. miRNA数据库以及测序物种基因组比对;
4. 与其他RNA数据车的比对;
5. 预测全新的miRNA;
6. miRNA序列本身相关分析;
7. miRNA定量分析,多样品miRNA表达差异分析;差异表达miRNA筛选及计;miRNA表达模式聚类分析(仅限多样本项目);
8. 重复相关性检测(仅限生物学重复样本);
9. 差异表达miRNA靶基因预测(植物采用Targetfinder软件,动物采用Targetscan和miRanda软件);
10. 差异表达miRNA的靶基因GO,KEGG注释;GO,KEGG富集性分析; pathway通路分析和pathway network分析(仅限多样本项目)。