描述
MicroRNA (miRNA) 是一类长度约为20-24个核苷酸长度的具有调控功能的非编码RNA,miRNA 是生物体内一类重要的特殊分子,诱导基因沉默,参与细胞生长、发育、基因转录和翻译等诸多生命活动的调控过程。
技术优势
文库优化:针对动植物miRNA序列的不同特别,优化文库制备流程,最大程度地富集样本小RNA序列
独家分析软件:拥有自主开发的数据分析软件ACGT101-miR,可靠性已被数百个实验项目检验;生成图表可直接用于论文撰写。
项目经验丰富:国内最早提供小RNA测序服务的公司之一,用户已发表上百篇小RNA测序相关论文。
技术路线
描述
研究内容
小RNA是生物体内一类具有重要调控功能的非编码短小RNA的总称。大量研究已经证实,小RNA几乎参与调控了动植物所有的生命过程,包括细胞增殖,分化,凋亡等,并且与人类疾病的发生发展密切相关。小RNA测序正是对这一类重要的调控小RNA——特别是microRNA(miRNA)展开分析,利用高通量测序技术对样本中18~30nt的小RNA序列进行鉴定和分析。依托联川生物丰富的测序经验和独有的测序分析软件,通过小RNA测序可以快速鉴定物种全谱的小RNA组,并预测新的miRNA,同时可对miRNA的靶基因进行预测和功能分析。  
信息分析内容
1. 数据质控:测序质量值分布统计,测序碱基质量控制,测序数据产出统计;
2. 可比对测序数据的获得;
3. miRNA数据库以及测序物种基因组比对;
4. 与其他RNA数据车的比对;
5. 预测全新的miRNA;
6. miRNA序列本身相关分析;
7. miRNA定量分析,多样品miRNA表达差异分析;差异表达miRNA筛选及计;miRNA表达模式聚类分析(仅限多样本项目);
8. 重复相关性检测(仅限生物学重复样本);
9. 差异表达miRNA靶基因预测(植物采用Targetfinder软件,动物采用Targetscan和miRanda软件);
10. 差异表达miRNA的靶基因GO,KEGG注释;GO,KEGG富集性分析; pathway通路分析和pathway network分析(仅限多样本项目)。